Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms