Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCK1P16333 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms