Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms