Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIMD1P0DJR0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms