Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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