Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms