Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNC1O60486 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNC1O60486 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms