Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms