Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF22A3QJZ6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms