Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GY48 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GY48 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GY48 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GY48 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms