Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms