Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms