Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms