Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms