Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C11orf49Q9H6J7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.1 ms