Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-6Q9BXR3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-6Q9BXR3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms