Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms