Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms