Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.5 ms