Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms