Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINGO1Q96FE5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINGO1Q96FE5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms