Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVB12AQ96EY5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms