Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms