Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms