Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX1Q92786 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms