Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms