Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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