Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms