Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIK3C3Q8NEB9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms