Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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