Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXPE1Q8N323 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms