Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms