Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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