Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP53Q70EK8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP53Q70EK8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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