Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms