Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C19orf48Q6RUI8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms