Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q6P435 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q6P435 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q6P435 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q6P435 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q6P435 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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