Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRC8EQ6NSJ5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms