Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms