Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms