Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC23Q53EV4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms