Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 4193.3 ms