Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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