Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms