Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF827Q17R98 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms