Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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