Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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