Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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