Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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UBE3CQ15386 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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UBE3CQ15386 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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UBE3CQ15386 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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UBE3CQ15386 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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