Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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